圣彼得堡是俄罗斯的主要轨道交通枢纽，主要火车站有5个：
莫斯科火车站(Московский вокзал，Moscovskii)
连接目的地：莫斯科，诺夫哥罗德（Novgorod），乌克兰，阿塞拜疆，伏尔加格勒（Volgograd），喀山（Kazan），萨马拉（Samara）等。
维捷布斯克火车站(Витебский вокзал,Vitebskii)
连接目的地：普希金城（Pushkin），白俄罗斯（Belarus），捷克、匈牙利、波澜、乌克兰、罗马尼亚、保加利亚、德国、摩尔瓦多、立陶宛、爱沙尼亚。
波罗的海火车站(Балтийский вокзал,Baltiskii)
连接目的地：夏宫、罗蒙诺索夫（Lomonosov）等地。
拉多加火车站(Ладожский вокзал,Ladozhskii)
连接目的地：摩尔曼斯克（Murmansk）、叶卡特琳堡（Ekaterinburg）、赫尔辛基。
芬兰火车站(Финляндский вокзал,Finliandskii)
连接目的地：目前作为往来芬兰赫尔辛基之间的高速火车专列，也可以到维堡（Vyborg）。
注意
原Varshavskii火车站(Варшавский вокзал)目前已经关闭，可以在各个火车站或中央火车站的售票处买票，目前有的车次已经开始使用电子车票。
