爱妮岛也一个小机场，能起降小飞机，可从马尼拉直飞爱妮岛，但机位有限，价格高昂。
岛屿航空公司（ISLAND TRANS-VOYAGER INC）(简称I.T.I.)
采用德国制多尼尔228型19人座飞机，每天2-3班机，从马尼拉前往爱妮岛机场，飞行时间约1小时15分钟。
网址：
航班时刻
1月-12月
7:30-8:45，马尼拉——爱妮岛
9:30-10:45，爱妮岛——抵达马尼拉
10月-5月 (增加下午航班)
3:30-4:45，马尼拉——爱妮岛
5:00-6:15，爱妮岛——马尼拉
（旺季追加中午班机）
旅客应在起飞前一小时办理登机手续。建议旅客备长袖上衣或薄外套一件，在机上备用。候机楼有点心及咖啡、茶，欢迎免费享用。

公主港的汽车总站开往爱妮岛的班车，约8小时，300比索
沙邦车站开往爱妮岛的班车，约7小时，1500比索。
爱妮岛车站开往科隆岛的班车，约9小时，650比索。