科布多城位于阿尔泰山北麓，海拔1200米，城区面积约20平方公里。城东25公里处有哈尔乌苏湖，并设有国家级的马罕自然保护区。科布多城是蒙古国西部重要的交通枢纽，有民用的科布多机场，并有往返乌鲁木齐的航线。