乌鲁木齐博物馆和新疆博物馆的主要区别在于其建筑风格和收藏品。 乌鲁木齐博物馆是一座历史悠久的博物馆，其建筑风格充满了古典和民族特色。它位于乌鲁木齐市中心，是一座具有重要历史和文化价值的建筑。该博物馆的藏品包括各种历史文物、艺术品和文化遗产，展示了乌鲁木齐地区的历史和文化。 相比之下，新疆博物馆的建筑风格更加现代化，具有宽广的展览空间和先进的设施。该博物馆的藏品包括各种珍贵的历史文物、艺术品和自然遗产，展示了新疆地区丰富多样的文化和自然景观。 总的来说，乌鲁木齐博物馆和新疆博物馆都是乌鲁木齐市的重要文化机构，它们分别代表着不同的历史和文化背景，具有各自独特的价值和意义。