客运汽车
南投各个乡镇之间，靠客运汽车连接交通。草屯、南投市、埔里、竹山、水里是南投五大转运站，可在这些客运大站搭乘巴士，前往南投各地。而埔里是位于台湾岛的地理中心，去往日月潭和清境农场都比较方便。竹山则是往鹿谷、溪头、杉林溪的转运站。
南投客运车站
客运公司——国光客运、统联客运、彰化客运、员林客运、南投客运、总达客运、杉林溪游乐事业、台西客运、台中客运可抵达目的地（南投范围）——埔里、水里、溪头、杉林溪、乡亲寮、草屯、鹿谷乡、竹山镇、集集镇等
地址：南投县南投市三和三路附近
网址：
埔里总站
地址：埔里镇中正4 路18 号埔里酒厂隔壁
联系方式：(886-049)2984031
埔里转运站
地址：埔里镇中正路338 号
联系方式：(886-049)2996147
草屯站
地址：草屯镇太平路2 段236 号
联系方式：(886-049)2333413
员林客运竹山站
地址：南投县竹山镇菜园路21 号
因为台湾的客运公司有很多，往往一个车站会有多家客运公司，所以乘坐车次需要提前去购票或者在官网上查明。
“台湾好行”观光巴士
台湾好行观光巴士提供多条串联台湾各个观光景点的便捷线路。其中南投有两条，分别是日月潭线与溪头线。
台湾好行官网：
日月潭线
线路：台中干城站——台中火车站——大庆火车站——高铁台中站——爱兰桥头( 牛耳石雕公园)——暨南大学——桃米坑( 纸教堂)——大雁( 涩水社区)——鱼池——日月老茶厂——日月潭
参考票价：台中干城站出发单程190NTD；往返340NTD；
购票地点：车上售票，可使用多卡通（可刷悠游、一卡通< 高捷卡> 及e通卡）
溪头线
线路：台中干城车站——台中火车站( 神鉴大楼原金莎百货)——民兴公园——大庆火车站——高铁台中站——车笼埔断层保存园区——竹山交流道——竹山工业区站——初乡——中兴蜂场——鹿彰站——鹿谷乡农会——广兴——内湖——内湖国小——湾坑——米堤大饭店——溪头
参考票价：台中干城站出发单程175NTD、往返330NTD；高铁台中站出发单程175NTD、往返330NTD。
购票地点：
（1）车上售票，可使用多卡通（可刷悠游卡、一卡通< 高捷卡> 及e 通卡）；
（2）台中干城站南投客运柜台 (886-04)22256418（台中市双十路一段35-8 号）；
（3）高铁台中站南投客运柜台 (886-04)36018665 （站区1 楼第5出入口第3 月台）；
（4）溪头站员林客运柜台 (886-049)2612315（鹿谷乡内湖村兴产路1-4 号）
悠游卡、高捷卡、e 通卡的区别与使用详情，请见实用信息部分。
交通卡
台湾面积虽小，但景点多而分散，搭乘不同的交通工具会影响整个旅游行程的计划。所以到台湾旅游一定要先认识好交通卡。
悠游卡
可用于搭乘台北捷运、台湾的市区公车、短程客运以及在公有停车场使用。全台湾只有台北和高雄有捷运，而悠游卡只能用于台北捷运 ，想要搭乘高雄捷运的，可以买票或者购买高雄捷运的“高捷卡”。而台湾岛内公车（包括台湾好行）都能使用悠游卡支付。在台中坐公交，使用悠游卡支付，车程在8 公里以内是免费的！所以到台湾旅游，尤其会到台北、台中的朋友一定要买一张悠游卡！
e 通卡
e 通卡共有两种，一种是高速公路电子收费卡，一般是在台湾本地自驾游的朋友会用到，它可以用来支付过桥过路费；另一种是e 通联名卡，具有银行金融支付（可以在便利店买东西或者搭乘公共交通）和高速公路电子收费支付功能，但不能保证可搭乘台湾本地所有客运和公共交通工具，一般到台湾旅游（非自驾游）不需要购买。
高捷卡（一卡通）
因为高雄捷运与台北捷运并不是一家运营公司，所以乘坐这两地捷运的时候需要不同的交通卡支付。在高雄乘坐捷运可以买当日电子票或者购买一卡通，而且现在在高雄使用一卡通还享受一定的优惠活动：
1、使用一卡通搭乘高雄捷运享受85 折优惠；
2、从捷运站出站后的30 分钟内，换乘公共脚踏车，享受减免4NTD 优惠；
3、从捷运站出站后的2 小时内，换乘高雄市公共交通，享受减免6NTD优惠。
在高雄市内使用一卡通也可以搭乘市内公交。
青年旅游卡
为鼓励青年到台湾旅行，特针对境内外15-30岁的青年，发行青年旅游卡，凡持旅游卡即可享有景点门票、交通、住宿、美食及购物等多项优惠。申办资格凡是15-30岁的境内外青年，出示有效身分证明文件，在台中机场、台中火车站、台中高铁站、台中市政府观光旅游局( 丰原区阳明街36号) 或台中市青年志工中心( 北区育才街3巷3号3楼之4) 办理，填妥青年旅游卡申请书即可现场发卡。
1、申办方式
（1）办卡不需缴交任何费用。
（2）请记得携带证明年龄之身分证件（出示护照或入台证及台湾通行证）；
（3）现场填妥青年旅游卡申请书后立即发卡。
2、使用时限
青辅会2006 年首创发行的青年旅游卡，及后续发行之2007、2008 年青年旅游卡，皆已延长使用期限至2015 年12 月31 日。
包车
南投县面积较大，景点之间基本靠客运车辆进行交通，所以可以选择包车，这样前往各景点更加方便快捷。
包车参考网址：