马祖位于福建省闽江口。又名马祖岛、马祖列岛，通称马祖地区，一般简称马祖，面临闽江口、敖江口和罗源湾，与大陆一水之隔，为海运要冲。现主要由南竿岛、北竿岛、高登岛、亮岛、东莒岛、西莒岛、东引岛、西引岛及其附属小岛共计三十六个岛屿、礁屿组成。马祖行政区划上属于福州的连江县，由于历史上的国共内战，原连江县一分为二，之后台方把马祖列岛合并成立了连江县府，位于中国大陆的连江县主体则为中国大陆政府所治，设福建省福州市连江县。这成为唯一两岸分治的县份，形成今日两个“连江县”的特殊情况。