清水河县因境内有清水河而得名，地处内蒙古高原和黄土高原交接地带，境内山地最多，滩川地甚少，整个地形是山、川、沟相间，山峦起伏，主要山脉有盘山、玉屏山、金盖山、银矿山、火石山、青龙洞山、馒头山、芦草山、紫金山。摇林沟自然保护区位于清水河县东南部，野生动植物资源丰富，狐狸、獾、兔、狼、黄鼠、鹰、啄木鸟等常出没于此。