内部交通概况
沙巴州主要的城市、埠镇都有完整的公路系统连接。巴士快车载送游客往返主要城镇，而迷你巴士则在市区近郊载客。从首府亚庇启程的旅客，也可乘搭空调游览车或小型巴士往返各主要埠镇。从首府到斗湖的车程约9个小时，山打根、拿笃、仙本那之间，也有频密方便的陆路交通连系网络。
旅游巴士 (Express Bus / Bas Ekspres)
长途巴士对自由行和背包族旅行者是一项相当经济、安全和便捷的选择。沙巴的长途巴士大多设有空调和宽敞舒适的座位，有些还有音响及电视机。长途巴士的班次多，而且行驶于沙巴所有主要的大城小镇之间。行程中除了中途暂停用餐或让游客上洗手间外，几乎都不休息。这些长距离的路线，由几家巴士公司共同经营，每天都有上午和下午车次。
在巴士站有各公司的售票柜台，票价大致上相同。车站一般早上7:00左右已开始作业。有的小型巴士会等乘客人数足够了才出发。沙巴交通状况良好，不常塞车。越州行程以汽车或巴士（公交）川行于古晋(沙捞越)，文莱及沙巴容易安排，在抵达每个边境关卡时，护照都必须盖章通行。
在车站购票前往目的地时，你可询问和安排回程时间表和上车地点，也可购买双程车票。同一路线可能有几家公司共同经营，上车前请确认车票上的公司商号名称和巴士相符。
迷你巴士 (Mini Bus / Bas Mini)
在沙巴主要城市，都以迷你巴士往来市区各固定路线( 如Inanam，Tuaran，Penampang，Tanjung Aru，Luyang，Putatan)。迷你巴士车身旁都印有所经地区路线。由于收费低和车次频密，是逛市内景点的理想交通工具。但它的车身小、大多数都没安装空调、繁忙时段人多
时车内会很拥挤，没计程车那么舒服。迷你巴士在早上和下午的车次非常频繁。到了晚上，车次就比较少了。上了车后付款时，需自备好现金
零钱( 一些1马币纸币或硬币)。偏僻乡村内也有迷你巴士，但许多无执照，为安全起见，请勿乘搭此类无证迷你巴士。
出租车 (Taxi / Teksi)
如果游客完全不知路况而不想到处摸索，可考虑乘搭出租车。你在许多饭店、主要商场或购物中心附近都可找到出租车站，也可以在饭店柜台询问和安排的士接送。马来西亚出租车车身黑黄或红白相间，印著"Teksi"，"Teksi Bermeter" 或“Kereta Sewa”的字样，大多都有冷气。
虽比起公车方便和舒适，但费用较高。若行李多和人多，共乘出租车是较好的选择，比单独搭乘省钱。价钱行情可以向饭店事先打听。游客也
可和司机商讨包车，让他负责同日接送和跟随乘客到几个景点。
火车（Train /Kereta Api)
沙巴拥有东马来西亚婆罗洲唯一的火车服务。火车的总站位于离亚庇市与国际机场约10km的丹绒亚路(Tanjung Aru)。您可以从丹绒亚路乘坐火车到达丹南 (Tenom)，途中会经过Putatan、Kinarut、吧巴镇 (Papar)、Kawang、Kimanis、Bongawan、Membakut、保佛镇（Beaufort）、Rayoh 和Pangi等市镇。
渡轮 （Ferryboat / Perahu Tambang）
沙巴很多国家公园都位于沿岸地区，大部分更是岛屿，若要前往必须要乘渡轮。故此，渡轮在沙巴也是很普及的交通工具。
Labuan Express 每天有四班船来回亚庇市及Labuan。
亚庇开出的渡轮往返时间如下
08:00 08:30 10:00 10:30 13:30 13:00 15:00
收费方面，经济船舱每位28马币，十二岁以下15马币，贵宾舱每位33马币，十二岁以下20马币。所有收费须再另加0.5马币作为政府税。
租车（Car Rental / Sewa Kereta）
游客在沙巴租车需要持国际驾照或经中国当地翻译且在公证过的中国驾照。机场内有租车柜台，城市内的大型商场也不难找到租车服务。租车公司分为国际品牌租赁公司和私人公司，私人公司价格便宜一些，还可以议价。
价格参考：4-5人座,大概在80-120马币/天。 7人座,120-200多马币/天不等。
在马蜂窝当地游频道可预订亚庇的专车服务，并提供中文微信客服服务。
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租车小贴士 马来西亚的汽车是右座驾驶 ( 靠左行驶) 您必须拥有国际驾照（未超过有效期）才可租车 司机和前后座乘客必须扣安全带 晚上7 时至早上7 时必须开着车灯照明 行驶中使用手机/ 移动电话是触犯交通法令的 在交通灯处，必须等绿灯才可转左或转右（虽然某些国家允许） 汽车后座乘客扣安全带措施将于2009 年1 月1 日起强制施行。
如何去往潜水点
西海岸以沙巴首府亚庇市为中心，东北海岸是山打根市，东南海岸是仙本那小镇——这三个基点基本辐射了以上潜水区域。国内出发的话，一般是在吉隆坡转机，可以抵达亚庇、山打根、斗湖等机场，而南方的旅行者可以从深圳、澳门、香港直飞亚庇，享受更短的航程和更少的旅行时间。
以亚庇为中心
1.直接从码头坐船去迪加岛 （Tiga Island）和东姑阿都拉曼海洋公园 （Tunku Abdul Rahman Park）。
2 .坐车去北部的古达毛律镇( Ko t a B e l u d ) 的瓜拉阿拜 (Kuala Abai)，坐船可以抵达曼达那尼岛 (Mantanani
Island)。
3.坐长途巴士去仙本娜，全程9小时，费用60马币。
4.坐飞机到斗湖，一小时。
以山打根为中心
坐船可以直接抵达兰卡央岛 (Langkayan Island)。坐车5小时左右可以抵达仙本那。
以斗湖为中心
搭车到仙本那，然后快艇可以抵达马达京、马布岛、卡帕莱等等这些岛屿。